بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های ویروس موزائیک جنوبی مرغ بر اساس ترادف نوکلئوتیدی ناحیه ´3 ژنوم

Authors

فریده فرح بخش

محمود معصومی

علیرضا افشاریفر

کرامت اله ایزدپناه

abstract

ویروس موزائیک جنوبی مرغ (bermuda grass southern mosaic virus, bgsmv)، فراوان­ترین ویروس­ مولد موزائیک در مرغ در نواحی گرمسیری جنوب ایران می­باشد. به منظور تعیین تنوع ژنتیکی bgsmv، گیاهان مرغ با علائم موزائیک از جیرفت، بوشهر، برازجان، رامهرمز، اندیمشک، شوشتر، بهبهان و داراب جمع آوری و ناحیه ´3 ژنوم آنها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی این ویروس با روش rt-pcr تکثیر و همسانه سازی شد. ناحیه cp-utr این جدایه­ها به همراه تعدادی از ترادف­های پوتی ویروس­های غلات موجود در بانک ژن مقایسه و پس از انجام همردیف سازی چندگانه، مورد تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی قرار گرفت. جدایه­های مورد مقایسه در درخت فیلوژنتیکی در 6 شاخه جداگانه قرار گرفتند که عبارت بودند از: bgsmv، ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (maize dwarf mosaic virus, mdmv)، ویروس موزائیک نیشکر (sugarcane mosaic virus, scmv)، ویروس موزائیک قیاق ( johnson grass mosaic virus, jgmv)، ویروس موزائیک سورگوم (sorghum mosaic virus, srmv) ودو ویروس موزائیک ایرانی قیاق ( iranian johnson grass mosaic virus, ijmv) و موزائیک زآ ( zea mosaic virus, zemv) که در یک شاخه قرار گرفتند. در بین پوتی ویروس­ها، bgsmv بیشترین تشابه را با mdmv داشت. اما در ناحیه 5 ژن پروتئین پوششی bgsmv، 90 نوکلئوتید (معادل 30 آمینو اسید) بیشتر از mdmv داشت و این مساله در تمام جدایه­های bgsmv صادق بود. میانگین درصد تشابه نوکلئوتیدی ناحیه cp-utr بین جدایه­های bgsmv، 1/98 درصد به دست آمد که نشان دهنده تنوع ژنتیکی پایین این ویروس در این ناحیه از ژنوم است. به رغم وجود تشابه نوکلئوتیدی بالای bgsmv با mdmv، با توجه به تفاوت­های اساسی از نظر دامنه میزبانی و سرولوژی بین دو ویروس و وجود یک قطعه 90 نوکلئوتیدی اضافی در ناحیه ´5 ژن cp، bgsmv به عنوان گونه­ای نزدیک به mdmv در جنس پوتی ویروس در نظر گرفته می­شود.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌های ویروس موزائیک جنوبی مرغ بر اساس ترادف نوکلئوتیدی ناحیه ´3 ژنوم

ویروس موزائیک جنوبی مرغ (Bermuda grass southern mosaic virus, BgSMV)، فراوان‌ترین ویروس‌ مولد موزائیک در مرغ در نواحی گرمسیری جنوب ایران می‌باشد. به منظور تعیین تنوع ژنتیکی BgSMV، گیاهان مرغ با علائم موزائیک از جیرفت، بوشهر، برازجان، رامهرمز، اندیمشک، شوشتر، بهبهان و داراب جمع‌آوری و ناحیه ´3 ژنوم آنها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی این ویروس با روش RT-PCR تکثیر و همسانه‌سازی شد. ناحیه CP-UTR ...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های ویروس موزائیک جنوبی مرغ بر اساس ترادف نوکلئوتیدی ناحیه ´۳ ژنوم

ویروس موزائیک جنوبی مرغ (bermuda grass southern mosaic virus, bgsmv)، فراوان ترین ویروس مولد موزائیک در مرغ در نواحی گرمسیری جنوب ایران می باشد. به منظور تعیین تنوع ژنتیکی bgsmv، گیاهان مرغ با علائم موزائیک از جیرفت، بوشهر، برازجان، رامهرمز، اندیمشک، شوشتر، بهبهان و داراب جمع آوری و ناحیه ´3 ژنوم آنها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی این ویروس با روش rt-pcr تکثیر و همسانه سازی شد. ناحیه cp-utr ا...

full text

خالص‌سازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس

ویروس موزائیک زرد کدو (Zucchini yellow mosaic virus) ازنمونه‌های کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه به‌عنوان جدایه فارس این ویروس ((ZYMV-F به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. ZYMV-F در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافت‌های آلوده برای خالص‌سازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتی‌سرمب...

full text

آنالیز ترادف نوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت و بررسی منشاء و تکامل آن

ترادف کاملنوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (Maize dwarf mosaic virus MDMV-Ir) تعیین گردید. ژنوم ویروس بجز دنباله Poly A انتهایی ʹ3، 9499 نوکلئوتید بود که شامل 139 نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی ʹ 5 و 234 نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی ʹ 3 و یک چارچوب باز خواندنی که یک پلی پروتئین با 3042 اسید آمینه را کد می کند را شامل می شد. MDMV-Ir  با سایر جدایه های ویروس4/86 تا 9/91 در‌صد شباهت...

full text

خالص سازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس

ویروس موزائیک زرد کدو (zucchini yellow mosaic virus) ازنمونه­های کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه به عنوان جدایه فارس این ویروس ((zymv-f به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. zymv-f در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافت­های آلوده برای خالص­سازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتی­سرمبه دست آمده...

full text

اثر دما بر خصوصیات بیولوژیک ویروس های موزائیک جنوبی مرغ و موزائیک کوتولگی ذرت و تعیین ترادف ژنوم کامل ویروس موزائیک جنوبی مرغ

نزدیکی بیولوژیکی، سرولوژیکی و مولکولی ویروس موزاییک جنوبی مرغ (bermuda grass southern mosaic virus, bgsmv) با ویروس خسارت زای موزائیک کوتولگی ذرت (mdmv) و همچنین پراکنش وسیع آن در مناطق جنوبی ایران از دلایل اصلی این پژوهش می باشد. آزمایش های نشان داد گیاه قیاق در مایه زنی مکانیکی با درصد خیلی پایین، به bgsmv آلوده می شود و شدت بیماری هر دو ویروس bgsmv و mdmv با افزایش دما روند صعودی دارد. ترادف...

15 صفحه اول

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
بیماریهای گیاهی

Publisher: انجمن بیماری شناسی گیاهی ایران

ISSN 2774-0006

volume 49

issue 1 2013

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023